基于IPA平台预测龟芍平颤方抗帕金森病的机制

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摘要目的基于生物信息学分析平台探讨龟芍平颤方抗帕金森病的分子机制。方法从1994年4月～2019年12月的中英文数据库（中国期刊全文数据库、维普期刊全文数据库、中国生物医学文献数据库、中华本草、PubMed、Web of Science、SciFinder Scholar）中获得龟芍平颤方（龟甲、白芍、川芎、天麻）的化学成分，并于PubChem数据库中查找该方每种有效成分的人源活性靶蛋白。检索Gene数据库，查找帕金森病相关人源基因。将上述靶蛋白与基因上传至生物信息学分析平台，分析两者共同涉及的分子网络与生物学通路。结果获得龟芍平颤方人源活性靶蛋白323个（龟甲58个、白芍119个、川芎72个、天麻74个）；获取帕金森病相关人源基因392个。建立上述靶蛋白及基因共同作用的主要分子网络，并甄选出G-蛋白偶联受体信号传导通路等10条主要的生物学通路。结论龟芍平颤方可能通过调控G-蛋白偶联受体信号传导通路等发挥抗帕金森病作用。

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	吴倩谭莉娟张炅璐何涛志陈灵修颜显欣刘红杰

关键词 ：帕金森病, 龟芍平颤方, 生物信息学分析平台, G蛋白偶联受体

Abstract：Objective To explore the molecular mechanism of Guishao Pingchan Formula against Parkinson′s disease (PD) based on ingenuity pathway analysis (IPA) platform. Methods The chemical constituents of Guishao Pingchan Formula [Carapax et Plastrum Testudinis (Guijia), Radix Paeoniae Alba (Baishao), Rhizoma Ligustici Chuanxiong (Chuanxiong) and Rhizoma Gastrodiae (Tianma)] were searched from China national knowledge infrastructure (CNKI), viper database (VIP), China biology medicine disc (CBMdisc), Chinese materia medica, PubMed, Web of Science, SciFinder Scholar and active target proteins were retrieved from PubChem from April 1994 to December 2019. Meanwhile, PD related genes were retrieved from Gene. Finally, target proteins of Guishao Pingchan Formula and PD related genes were uploaded to IPA platform, and the molecular networks and classical biological pathways involved in them were compared. Results Three hurdred and twenty-three human active target proteins (58 Guijia, 119 Baishao, 72 Chuanxiong, 74 Tianma) and 392 PD related genes were obtained, then a major molecular network in which both were involved were built. Meanwhile, 10 main canonical pathways involved together were selected, such as G-protein coupled receptors signaling. Conclusion Guishao Pingchan Formula might play an anti-PD role by regulating G-protein coupled receptors signaling and other pathways.

Key words： Parkinson′s disease Guishao Pingchan Formula Ingenuity pathway analysis platform G-protein coupled receptors

基金资助:广东省基础与应用基础研究基金项目（2019A15 15010644）；
广东省中医药局科研项目（20201073）；
山东省重点研发计划项目（2018GSF118149）。

通讯作者: 刘红杰（1974.5-），男，博士，副教授，硕士生导师；研究方向：中医老年病。

作者简介: 吴倩（1994.3-），女，暨南大学中医学院2017级中西医结合临床专业在读硕士研究生；研究方向：神经内科。

引用本文:

吴倩谭莉娟张炅璐何涛志陈灵修颜显欣刘红杰. 基于IPA平台预测龟芍平颤方抗帕金森病的机制[J]. 中国医药导报, 2020, 17(16): 11-15.
WU Qian TAN Lijuan ZHANG Jionglu HE Taozhi CHEN Lingxiu YAN Xianxin LIU Hongjie. Mechanism prediction of Guishao Pingchan Formula against Parkinson′s disease based on IPA platform. 中国医药导报, 2020, 17(16): 11-15.

链接本文:

http://www.yiyaodaobao.com.cn/CN/ 或 http://www.yiyaodaobao.com.cn/CN/Y2020/V17/I16/11

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